本片改编自平库waka的同名漫画，26岁的椎野智世从电视新闻中得知好友真理子去世的消息，真理子从学生时代开始就受到父亲的虐待，小椎决定为真理子做点什么。为了拯救真理子的灵魂，小椎决定夺走她的骨灰，展开一次特别的旅行。
本片讲述相爱的人成为陌生人为止的故事。
正就读中学的少年迈尔斯（沙梅克·摩尔ShameikMoore配音）意外被一只遭受放射性污染的蜘蛛咬伤，随后身体发生奇特的变化。偶然机缘，他目睹了蜘蛛侠（克里斯·派恩ChrisPine配音）和犯罪头目金并（列维·施瑞博尔LievSchreiber配音）的战斗。为了阻止金并利用时空对撞机扰乱宇宙，蜘蛛侠最终壮烈牺牲。可未过多久，来自平行宇宙的颓废的彼德·帕克（杰克·约翰逊JakeM.Johnson配音）出现在迈尔斯面前。为了阻止金并的阴谋，并帮助这个帕克返回自己的宇宙，他们闯入金并的老巢。在这一过程中，二人遭到章鱼博士和徘徊者的狙击。与此同时，来自其他宇宙的女蜘蛛侠、暗影蜘蛛侠、蜘猪侠、二次元蜘蛛妹相继出现。他们合力与恶势力展开斗争……
