人心，是一门深奥的科学。人会犯罪作恶，皆因被贪婪、愤怒、软弱和嫉妒等情绪支配。为了逃避刑责，人会利用谎言掩饰真相，用诡计扰乱视线，令法证工作难上加难。未破的悬案、消失的证据、迷失的困局，都是法证团队面对的一个个难关。纵然过程中会受到打击，但他们都会坚持初心，跌倒之后重新出发，不会放弃追寻真相。 《法证先锋V》的案件和布局更加让人意想不到，唯有靠着“法证部”、“法医科”及“重案组”这灭罪铁三角，秉承前四季的理念，通力合作，找出真凶，还生者公道，替死者雪冤。
三叶（北乃绮 饰）是冲田总悟（吉沢亮 饰）的姐姐，某一日，她告知弟弟自己即将和一位名叫藏场当马的男子结婚。实际上，三叶和土方十四郎（柳乐优弥 饰）曾经有过一段没有结果的情缘，当时，土方冷漠又决绝的拒绝了三叶的示好，这也是总悟憎恨土方的最主要的原因。可实际上，在他们两人的心中，依然保留着对于彼此最纯粹的感情。 三叶的身体一直不好，病情突然恶化的她昏倒被送往了医院。与此同时，真选组组长近藤勋（中村勘九郎 饰）发现，三叶的未婚夫一直在从事着走私军火的非法勾当，在背后支持他的，是庞大而又可怕的黑恶势力。愤怒的总悟决定替姐姐报仇，万事屋的老板坂田银时（小栗旬 饰）亦被卷入其中。
从日本逃亡的海南学子刀锋在回乡途中，与共产党员马啸和国军军官王师北结识，并得到了日军圣物——断喉弩。不料回到家乡海塘城，迎接刀锋的却是被夺走的家业与母亲的牌位，而父亲将被处以极刑！愤怒的刀锋拿起断喉弩，带领旧日家仆走神婆、鬼叔、鸡饭仔、贾半仙、肥仔妈一众，劫法场救父亲，夺回家业，在海南一日成名。同时，泼辣勇敢的未婚妻麦子与共产党员胡畔走进了刀锋的生活。日军登陆，遍地鲜血和硝烟。眼看亲人被屠戮，刀锋——这个昔日的富家少爷，领着家仆与胡畔、马啸、王师北同行，将鲜血洒遍琼崖大地，演绎了一场气势磅礴的抗日传奇！
