这是[古惑仔情义篇之洪兴十三妹]的延续篇。反映澳门极其阴暗的一面，既一片繁荣之后的人心茫茫，影片故事略显松散，吴君如再度饰演古惑仔经典人物“十三妹”，欠缺新意。因为父亲患上了帕金森症，使离开澳门十七年的十三妹（吴君如饰）重回旧地，临危受命接掌家族生意，其实所谓家族生意就 是澳门繁荣的黄色事业
　　对黄色事业一窍不通的十三妹，希望得到旧日友人的帮助，但她渐渐发现昔日老友指天椒、Johnny、甘神父等人也有极大转变，十三妹内心更觉彷徨。回归后的澳门经济上渐有起色，连带黄赌事业均蓬勃发展，但人心却反被欲望蒙闭。面对澳门人和事的变迁，十三妹满心感慨......

　　武师陈厚德（元华 饰）远赴美国开设宝芝林，时常召唤国内的徒弟阿杰（李连杰 饰）来美国帮衬，但阿杰担忧在美的居留问题，迟迟未到。陈厚德曾经收下一名美国弟子尊尼（杰瑞•特林伯 饰），尊尼学成后却挑战师傅，意欲扬名立万扩张自己的武馆，陈厚德被尊尼打成重伤，宝芝林也被砸烂，幸好有少女安娜路过，将陈厚德救走。几乎同时，阿杰终于来美探望师傅，岂料一出机场便遭遇各种麻烦，先是莫名其妙收下三名落魄墨西哥少年为弟子，又与查封宝芝林的银行地产部经理阿美（郭锦恩 饰）不吵不相识。阿杰因语言不通，守候宝芝林寻找师傅下落，而尊尼也在四处打探陈厚德的去向，一中一外两名弟子，将为义与利的不同追求狭路相逢……

　　著名音乐人顾家明（张国荣 饰）精心栽培了最受欢迎女歌星玫瑰（刘嘉玲 饰）。两人男才女貌，是十分相配的一对。他们的忠实fans林子颖（袁咏仪 饰）误打误撞成为了唱片公司的男新人，众人都没有发现其实林子颖是女扮男装的。子颖生活在偶像的圈子中才发现这对金童玉女正面临感情的考验。子颖的纯真同时吸引住了家明与玫瑰的眼球，分别对子颖产生了爱意。一段复杂的三角关系，引出不少笑料。

　　伟健与薇两夫妇因感情冷淡而分居，伟健与家琪成为同事，两人日久生情，谁料伟健与薇在女儿的拉拢下，又冰释前嫌，准备复合。家琪表面接受事实，更成为了薇的好朋友，但其实另有所图，她不甘就此放弃这断恋情，薇与伟健因此也都陷入了险境之中。

　　晓恩（张曼玉 饰）留学归来参加妹妹的婚礼，期间发觉与母亲葵子（陆小芬 饰）的隔阂与矛盾只增不减。直到陪母亲回日本探亲时，她才真正开始了解自己的母亲。原来在抗日期间到满洲投靠哥哥的母亲，结识了当时身为军官的父亲（李子雄 饰），并与其结婚，战后决定随丈夫一起搬到澳门生活。因 生活习惯和文化等各方面的差异，令母亲与公婆同女儿之间的隔阂与误解不断。然而在母女俩终于取得了沟通与谅解之时，却从大陆传来了从小带大晓恩的祖父中风不良于行的消息, 向来和他们不和的母亲却要求忙拍戏的女儿一定要去......

　　羅世傑為完成畢業論文, 找尋資料, 借宿劉忠河同學家, 某日士傑與劉婉憶入山考古, 忽忽天色已暗, 留宿山野, 夜晚婉憶尿急不慎跌落山洞, 驚現一具骷髏頭及令牌, 次日經考古教授確認係明朝古物, 並帶回保存. 一天婉憶打掃時不慎被骷髏頭刺傷, 血流滴進骷髏內而產生靈氣, 夜晚士傑回房潛研時却發現骷髏內現出鬼魂小娟是陽間的小娟隨即附身剛進房的婉憶身軀和士傑談天. 賈一道發現士傑被鬼魂纏身, 忠河與劉父作法護士傑, 這時陰陽魔要脅小娟聽命左右, 小娟不從被拘禁回骷髏頭內, 只好殺士傑以求解圍, 惜為符咒擊傷通時被魔女推救說明原委, 路上和呂道長二人鬥法, 魔女不敵魔王前來搭救, 陰魔王雖使出魔法迫戰, 而天已亮, 陰陽魔等人消失無踪. 呂道士得知陰陽魔法力無邊, 決定設壇誘捕, 以濟公活佛玄門迎戰敗下陣來, 只得犧牲小娟魂體結令令牌及骷髏碩一舉大敗陰陽魔, 眾人趕來祭拜小娟墳前, 邪總不勝正.

　　职业杀手高守（刘德华 饰）手段高强，深得女老板ICE（伍咏薇 饰）赏识，不意却激起另一杀手王昌（郑浩南 饰）的妒恨。某日，高守偶遇初出茅庐执行任务的女杀手如枫（袁咏仪 饰），并在对方的胁迫下带其逃离现场，而这一场相遇，在两人心中留下了不灭的痕迹。
　　警官董辉（李子雄 饰）保护的污点证人在开庭时被高守乔装的法官当众击杀，董辉至此开始对高守锲而不舍的追索。与此同时，高守与如枫的再次相遇点燃了两人的爱火，而如枫对高守的真实身份却一无所知。不久高守在一次任务中意外失手，ICE按照杀手组织规则指派如枫刺杀失败者，而已经对警方大开杀戒的王昌和步步紧逼的董辉亦先后将矛头对准了高守……

　　吴汉中（吴耀汉 饰）早年丧妻，独立抚养4个孩子：小东（林青霞 饰）、小南（张曼玉 饰）、小西（邱淑贞 饰）还有小北（林志颖 饰）。汉中的好友突然因病死亡，他感到生命的无偿，因此他想在有生之年可以看到孩子们成家立室，于是假扮绝症让女儿们带着男朋友回家。还是独身的女儿们只好找人假扮男友。小东找到一名男妓谢晒（梁家辉 饰），小南找到了一个黑社会的小混混（张学友 饰），小西找到的则是一个清纯男（郑伊健 饰）。这时汉中以前的女友（吴君如 饰）得知汉中的身家斐然又罹患癌症便想成为他的妻子，众儿女都看到她的面目，只是顾及父亲的时日不多。而她们也对各自的假男友，产生了真感情。

　　20年代末，为完成师父的志愿，陈真（李连杰 饰）到东洋学先进技术，他喜欢着日本女孩山田光子（中山忍 饰）。因为师父霍元甲之死，陈真回到中国，协助师父之子霍廷恩（钱小豪 饰）主持精武门的业务，不料却引起了他的妒忌，师兄弟之间引发权力之争。
　　另一方面，陈真追查师父死因，怀疑是日军 军官藤田刚（周比利 饰）暗中使用慢性毒药杀死霍元甲。陈真请医生验尸，证实师父确系中毒而死。藤田刚恐阴谋败露，杀人嫁祸，展开了连场恶斗。不久，藤田刚挑战精武门，他诱使日本黑龙会总教头船越文夫向精武馆挑战。比武之日，双方开展了一场惊心动魄的决战。

　　张翠山（吴镇宇 饰）携妻及子张无忌（李连杰 饰）从孤岛出发赶去给其师父贺百岁大寿的途中，被人暗算，张无忌中寒冰掌。在武当山，张翠山和妻子被各大门派逼迫致死，张无忌也不再能练习武功，只能靠张三丰每日所输真气得以残活。张三丰的举动引来宋青书（邹兆龙 饰）的妒忌，他联合了峨眉女弟子周芷若（黎姿 饰）共同对付张无 忌。明教圣女小昭（邱淑贞 饰）令张无忌改变命运，使其先在断崖上遇到高人治好体内寒冰毒、学会九成“九阳神功”，又在明教禁地练得“乾坤大挪移心法”。得知蒙古郡主赵敏（张敏 饰）设计令江湖六大派围攻光明顶想歼灭明教时，张无忌决意为拯救明教赴汤蹈火。

　　天无门主呼伦法师(张道饰)苦练「子阴毒功」有意称霸天下，作法取童子尿与胎盘，以供练功，手段残酷。高生(袁日初饰)乃阴阳堂弟子，无意中闯进禁地，发现「阴阳分元大法」秘籍，乃暗中偷练，但因根基浅薄，弄得魂魄离身，不能返回，幸得银久(李文泰饰)及时救助。海青派李天道遭天无门杀害，妹李剑娥(刘皓怡饰)遍访江湖寻兄。是夜正值关作法取童子尿，剑娥查悉制止……

　　水兒（傅欣瑜）原是大太子之私生女，流落青樓，二太子（梁家輝）欲利用水兒揭大太子醜行以謀皇位。大太子不惜派殺手暗殺水兒，而二太子則命燕十三（莫少聰）、練飛霞（余安安）等護送水兒回宮。兩批人沿途激戰，水兒得武士（董瑋）相救避禍隱居荒村，然二人性格迥異經常引起衝突……

　　爱打麻将的阿芳，结识了最讨厌麻将的男友阿友，唯有隐瞒她的嗜好，可惜最终纸也包不住火。阿友出尽法宝令阿芳放弃麻将，但也未能成功，后来阿芳答应他，若他在四方城内赢了她，她就听他的话，决不再打麻将。最后阿友请来名师指点，不但赢了阿芳，自此更爱上打麻将呢！

　　潇洒是一个船员，整天在海上漂泊，一去就是几个月，他的妈妈和小妹阿珍都很担心他。一天，潇洒回到家，妹妹非常惊喜，可是他的妈妈并不开心，觉得他没有出息。潇洒很是委屈，于是借酒消愁。阿珍和她的妈妈靠开小店为生，每天，早晨都有很多出租司机来照顾她们的生意，其中有一位司机阿光对阿珍有意思，经常来帮助她们。一天，政府通知他们，房子半年后要撤，但是他们一时又拿不出钱去买新的房子，为了筹钱，于是一家人在阿光的帮助……

　　警官秦SIR和妻子君如搬迁到一个小镇上，后来小镇连续发生了多起强奸案，怀疑对象集中到了村里的阿才和莫蛇两个地痞。可是随着案情的发展又都逐一排除了对他们的嫌疑。新迁入小镇的林医生行为令人捉摸不定，案发时他又都没有不在场的证据，遂成了新的嫌疑对象，拨开重重疑雾终于案情有了突破，可罪犯的魔瓜又伸向秦SIR的妻子君如。

　　史毕堡是个绝世桥王，好友高达威却是个有勇无谋的CID。威常被妻阿Kit与“大男人协会”主席毛良道有染，刚巧史又是该会成员，唯有向他求助。史一向鄙视女性，但毛良道亦非善类，能对付他的只有女手下朱歪女……

　　康熙晚年，众太子觊觎帝位，其中四太子胤祯与十四太子胤禵相争最激烈。康熙预立密诏传位于十四子，胤祯乃命年羹尧设法篡位于十四子，胤祯后以大将军职位。年助雍正得帝位后，受命西征，战无不胜，声名远播，雍正引以为忧，乃借机于一日之内连年羹尧十八级，由大将军降为城门的“外委把总”。年与志士密谋起义，却因事泄络被雍正所杀。

　　莎莉是一个坚强的职业女性，丧夫后与10岁儿子安仔相依为命。但她不幸患上血癌，只有6个月的寿命。安仔自幼依赖母亲，性格柔弱。为了培养安仔独立生活的能力，她把儿子关到郊外的孤儿院。安仔在孤儿院与其他儿童过着群体生活，培养出自立的性格与领导才能。

　　健美班女教练阿芝（梅艳芳 饰）和隔壁的私人侦探阿佐（万梓良 饰）是一对欢喜冤家，两人一见面便口角不断，笑话连连。
　　某天，四个劫匪抢劫了富商曹先生的名贵钻石，逃亡途中阴差阳错将钻石掉到了阿芝那里。一无所知的阿芝随后遭到劫匪们的追杀，最终被绑架而去。渐渐喜欢上阿芝的阿佐眼看心上之人身陷虎口，懊恼不已。幸亏其助手IQ博士送给阿芝的防狼器中藏有跟踪器，二人一路追踪到劫匪的藏匿窝点。却不知，阿芝几经周折已脱身而出。但穷凶极恶的劫匪怎肯罢休，誓要得到钻石为止，而他们的背后似乎又有个黑手暗中操控……

　　罗伯特（陈勋奇 饰）从小就失去了父母，和舅父相依为命的他在舅父的广告公司中谋得了一份不错的差事。克里奥帕拉（倪淑君 饰）是公司里的创意经理，长相甜美个性活泼的她吸引了罗伯特的注意，令罗伯特深陷情网不能自拔。
　　一次偶然中，罗伯特的舅父从古董店中偷得了一枚铜镜，让他没有想到的是，他竟然就此将一位古灵精怪的小狐仙也顺道带回了家。调皮的小狐仙附在了克里奥帕拉的身上，利用自己的法力和克里奥帕拉的身体制造了一连串的祸端，可即便如此，罗伯特还是深深的迷恋着她。为了让着了魔的侄儿还魂，罗伯特的舅父偷偷调换了铜镜，没想到却让罗伯特因此死于一场车祸，小狐仙现身施法，令时光倒转，想要救回这个痴心人。

　　高进（周润发 饰）前来香港与赌魔决斗，怎料刚抵港，便被南哥（杨泽霖 饰）追杀，结果堕入陷阱而失忆。幸得刀仔（刘德华 饰）和其女友珍（王祖贤 饰）相救，他们把高进带回家中疗养，发现高进精通赌术后，兴奋不已，想利用他来挣大钱，却反而因为高进发挥不稳亏了钱。
　　高进妻子遭其堂弟高义醉酒后污辱杀害。高义进而联手南哥，设计谋害高进，四处搜罗进的藏身地点，前往追杀。逃亡之时，高进翻车受伤，竟恢复了记忆——但是却怎样也记不起失忆期间的事情。刀仔提醒进，高义并非好人，但进却毅然蒙在鼓里，不知危难当头。

　　重案组沙展马军（甄子丹 饰）致力抓拿犯罪分子，身手不凡的他由于抓贼心切常常出手过重。警方一直搜集越南帮兄弟阿渣（吕良伟 饰）、Tony（邹兆龙 饰）、阿虎（行宇 饰）的犯罪证据，于是派出了华生（古天乐 饰）以卧底的身份潜入他们之间。三兄弟为人心狠手辣，想铲除掉眼中钉阿山。阿渣被抓后，Tony也识破了华生的真实身份，要将华生以及其他证人通通杀掉，救出大哥。华生女友秋堤（范冰冰 饰）被挟持，华生不得不放弃指证阿渣。华生与女友都抓走当人质，马军也带着阿渣去营救华生。

　　编号为223的警察（金城武）失恋后患上失恋综合症，在与金发女杀手（林青霞）擦肩而过又离奇相遇并有了一晚温情后，原本以为包括“爱情”在内的所有东西都有保质期的他意外地迎来心灵的短暂温暖。可是，他们的爱情还是结束了。
　　快餐店新来的女招待阿菲（王菲）爱上了时常光顾快餐店的编号 为663的警察（梁朝伟），因拆了他的女友（周嘉玲）留在快餐店给他的“分手” 信，阿菲知晓了他的心情，偷拿到他的钥匙趁他不在时常潜入他家，一边梦游一边悄悄地改变他的生活，终在被他撞见时令其感受到情感的回归。然而，这才是他们爱情的开始。