《打黑重案组》故事发生在南方市，当地的公安局打黑重案组遭遇到一桩棘手案件。在破案过程中，重案组受到各种各样的阻挠，案件侦破几度中断。但公安局长和乾警们不为困难所阻，不顾自己和家人所遭受的苦痛，坚持调查最终查清案情，一举打掉了南方市的黑恶组织。 2006年初秋，滨州市、香港乔氏地产公司驻滨州市项目代表郑天京被人在住所谋杀，他的尸体当晚被埋进了工地垃圾堆中…… 市公安局长陆啸天(卢奇饰)命刑警支队重案组长刘英来(祝延平饰)率重案组成员姚晃(吴樾饰)、依蔓(李依蔓饰)和飞飞(马丁诺饰)赶到案发现场投入侦查工作。重案组严格对死者死亡时间保密，发现死者与龙心集团董事长张伟及其部属有密切联系。张伟出身黑社会团伙，掌控滨州市黑白两道…… 同时，被刘英杰逮捕的杀手大脚(李槐龙饰)从服刑地新疆脱逃，潜回滨州市，被老大张伟窝藏起来。大脚仇视刘英杰，打算干掉刘英杰……重案...
路念，大学毕业那年就继承了父亲生前创办的路森健身房。初出茅庐的她，缺乏管理和运营经验，面对同行竞争，经营每况愈下。眼看父亲的心血就要付之东流，她只好变卖房产，搬进健身房，带着仅剩的四位员工勉强维持经营。在她期身处无盼的生活死水里，因父子关系不和，赌气回国的富家公子萧穆远却与她不期而遇。
廉署首席調查主任江見秋，在上市公司貪污案以準母親身份接近關鍵人物，找到破案缺口。總調查主任司徒啓文，在調查維修招標案中帶著助理調查主任丁芯假裝成父女買樓，並在槍隊成員徐浩南與助理調查主任鍾巧玲幫助下，成功遊說關鍵人物蒐集涉事建築公司的罪證。高級調查主任伍學賓，透過IT知識找出獄中是誰與外界溝通的痕跡，成功偵破懲教人員貪污案。即使巧玲與丁芯對中學工程貪污案涉案人物的判斷不同，二人甚至在保險行賄案因認識涉案人物而被停止接觸案件，強烈正義感與使命感無阻二人向著找出真相的目標進發。
以单元剧的形式集青春偶像悬疑推理爱情等一体，侦探詹天远（俞灏明饰）和伙伴们在调查一系列错综复杂的案件过程中，抽丝剥茧，将真相大白于天下。
