《灵剑尊》是由索以文化制作的3D动画。根据同名小说《灵剑尊》和漫画《灵剑尊》改编。该动画讲述了落魄少年楚行云立志要改变现状奋发图强创造一片新天地的故事 大梦一场，落魄少年立志要改变现状奋发图强创造一片新天地。珍奇异宝，功法武决，遗失的强者洞府，在这个天才辈出，充满挑战和机缘的时代，且看落魄少主如何闯荡大陆、遭奇遇，成为叱咤风云的至尊天帝。以前的仇人，现在，绝不会放过！梦中的遗憾，现在，一定要弥补！待到灵剑长啸之时，天地三界，我为至尊！
“上帝，世界今天依然健健康康地疯狂着。” 就读于东京都内私立高中的高一学生护郎，既没有“希望”、“梦想”，也没有“野心”。 有一天，护郎的手机收到了奇怪的通知：你被选中了，请说出你的愿望。 在许一个愿望后真实现的护郎面前，一个神秘的女孩拉尔出现了，她对一连串的事情感到混乱的护郎宣告残酷的命运。 护郎被“伟大的意志”选中，为了实现他的愿望，他将与其他神候选人竞争 "神 "的位置，互相残杀，直到只剩下一个。
在广袤无垠的蛮荒仙界，修仙文化盛行，凡人皆以成为修士为荣。大学生陆航之从现代穿越而来，成为紫云镇上的一介凡人小厮，每天过着如履薄冰的日子，但他不肯认命，一直努力上进，想要摆脱现状，力争上游。后来，因为一次善举，他得到朱府大小姐朱抚琴和其师兄冷无涯的赏识，被招入朱府接受考验，若能通过，就可获得拜入玄心宗成为修士的机会。陆航之把握时机努力做事，认真完成朱抚琴交代的所有任务。在此期间，他偶得意外机缘，凭借五百年份的灵果，提升资质，备受朱抚琴重视。朱抚琴觉得引陆航之入玄心宗能为自己增加助力，便给予多番援手，助其快速成长。陆航之也不负所望，通过不屑努力，最终通过考验，成为玄心宗外门弟子。然而，这仅仅是一个开始，陆航之的志向远不止于此，他想要更进一步，只有晋升至内门弟子，才能获得更多资源，确保拥有足够实力站稳脚跟。
神秘事件管理机构「民调局」的特别调查员沈辣，在执行任务中身受重伤，濒死之际接受了六室主任吴仁荻的传承-蕴含神秘力量的“种子”。苏醒后，吴仁荻师兄-广仁收其为徒。为寻天理图碎片，沈辣在历经天山狼冢、能量反噬、基金会密谋等事件后，终获吴仁荻认可，得到他给与的远古神器-罪罚双剑。与此同时，民调局的内鬼问题也更加扑朔迷离，沈辣和搭档孙德胜再次投入战斗。
高冷傲娇的建筑系天才学霸李季，被异世界生物闇麒麟绑架到了一个叫魄念空间的秘境，秘境中是一片远古天庭的废墟遗迹，闇麒麟告诉他，想要回去必须得通过天道的考验，而这个考验就是重建天庭……
