在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
隆和肯是很好的朋友，且都为武术家。为了成为更好的战士和学习新的技术，他们周游世界，接触许多不同的战斗风格，并结识新朋友。而在旅途中，他们发现自己被卷入了一个名为“影法”的神秘组织的阴谋中，现在他们都面临着终极挑战，并且必须在与邪恶的维加战斗时为自己的生命而战。
