講述了調查1%失蹤案件的專案組員警和惡性犯罪嫌疑人之間對決的故事。FBI出身的天才精英刑警吉秀賢(金康宇 飾)和純度100%的本土老派勢力刑警吳大榮(朴熙順 飾)的搭檔將怎樣在一定期限內找出失蹤者並與前所未聞的惡性犯罪者抗衡的故事，以‘失蹤’為主題，不僅將描繪尋找失蹤者的過程，還將會是一段尋找社會丟失的正義、價值的旅程，是一部全新題材的刑偵劇。
午夜12点，在繁华都市的一个小角落，一家食堂才刚刚开始营业。这家深夜食堂的老板(小林薰 饰)虽然脸上带着伤疤，却是一个温情且厨艺精湛的男人。虽然小店里的菜谱很简单，但是只要是客人想吃的都可以点，所以小店备受底层小市民的喜爱。延续第一季的风格，深夜食堂里每晚都上演一个耐人寻味的故事，每个故事的主角都有自己钟爱的一款美食。特别值得一提，第一季曾出现的红色香肠再度登场，其中埋藏多年的往事随之揭晓，曾经的故人再度聚首，又展开了一个崭新的温情故事…… 《深夜食堂》在2006年开始连载，由于作品气氛浓郁、风格特殊，二度改编日剧播映，由小林薰担任男主角。隔年获得“第55回小学馆漫画赏”及“第39回漫画家协会大赏”。
故事紧接上集发展。除掉魔尊后，日童（郭晋安 饰）同裘菁菁（杨羚 饰）结为连理，可是，成亲当天，裘菁菁却被河妖捉走，尽管幸免于难，脚上却多了一个会越变越大最终危及性命的金锁。为了救妻子，日童和月童（张卫健 饰）再度踏上了旅途，寻找可以破开金锁的金斧。 途中，两人结识了名为段飞（吴启明 饰）的男子，三人之间结下了坚实的友谊。寻得了金斧，两人却意外放出了妖王（罗莽 饰），之后，月童和段飞均爱上了名为小蝶（刘玉翠 饰）的美丽女子，两人因此而决裂。其实，小蝶的真实身份为雀妖，在一番波折之后，她终于与月童走到了一起，正当两人沉浸在幸福之中时，段飞却杀了他们一个措手不及。
