电子游戏高手朱事丁（郝邵文 饰）是个落寞的小孩，父亲朱义成（吴孟达 饰）、母亲宝英丹、兄长朱事文（吴家乐 饰）各忙各事，视朱事丁为讨人嫌的小东西。孤独的朱事丁捡到一张名为“黄金岛历险记”的游戏光碟，好奇试玩时居然连同兄长一起被吸入游戏中去。兄弟两人降落在混乱的海盗战场，不幸被海盗掳走。原来这群海盗的海盗船被黄金岛守护者小龙（释小龙 饰）锁在海湾，唯有偷到钥匙解锁才能出海，朱事文不慎落水，被黄金岛少女小仙（徐若瑄 饰）搭救，同时，海盗船长（楼学贤 饰）收朱事丁为义子，并怂恿他偷窃钥匙。游戏中的朱事丁为完成任务接近小龙，而真实世界中的父母正设法搭救电视机中的儿子……
卡勒姆·林奇（迈克尔·法斯宾德饰）在死刑即将执行之前清醒过来，发现他被索菲娅（玛丽昂·歌迪亚饰）选中，来参加一个能让人类摆脱暴力冲动的计划。虚拟现实机器Animus能让用户体验祖先的记忆，被绑在机器上之后，卡勒姆·林奇意识到他是生活在西班牙宗教法庭时期一位刺客阿圭拉的后裔，他们寻找的是可以控制自由意志的伊甸园苹果。索菲娅在父亲艾伦（杰瑞米·艾恩斯饰）施加的压力下不情愿地操纵着卡勒姆·林奇回到过去寻找伊甸园苹果在现代世界的下落，威胁着他身体和心理的健康。但在杀手同行穆萨（迈克尔·威廉姆斯饰）暗示了卡勒姆·林奇，提醒他艾伦有可能动机不纯之后，卡勒姆·林奇开始重新考虑他的行为和动机，而人类自由意志的命运也变得悬而未决……
