午夜12点，在繁华都市的一个小角落，一家食堂才刚刚开始营业。这家深夜食堂的老板(小林薰 饰)虽然脸上带着伤疤，却是一个温情且厨艺精湛的男人。虽然小店里的菜谱很简单，但是只要是客人想吃的都可以点，所以小店备受底层小市民的喜爱。延续第一季的风格，深夜食堂里每晚都上演一个耐人寻味的故事，每个故事的主角都有自己钟爱的一款美食。特别值得一提，第一季曾出现的红色香肠再度登场，其中埋藏多年的往事随之揭晓，曾经的故人再度聚首，又展开了一个崭新的温情故事…… 《深夜食堂》在2006年开始连载，由于作品气氛浓郁、风格特殊，二度改编日剧播映，由小林薰担任男主角。隔年获得“第55回小学馆漫画赏”及“第39回漫画家协会大赏”。
全新一季，继续有Janine Teagues（昆塔·布伦森 Quinta Brunson 饰）同一班同事面对有限资源，仍然不顾一切为教学理想而奋战。在新的学年，继续发挥爆笑基因。
明朝初期，平民夏浔盲打误撞代替死去的富商秀才杨旭，成为锦衣卫的一颗棋子，在目睹其监控者张十三等人对自己的心狠手辣后决定为自保而为民除害。同时，他结识了日后的妻子谢雨霏，两人开始了欢喜冤家般的相处。不久，夏浔在回老家的路上被锦衣卫的人追赶，遂被西门朗与纪纲搭救，三人一见如故成结拜兄弟。后三人无意间救了燕王夫妇和郡主，夏浔的能力引起锦衣卫两派首领白一夏和罗克敌的关注。夏浔经过白一夏和罗克敌的培养，成为一名优秀的锦衣卫。朱允炆登基后，开始着手削藩，心怀家国的夏浔为免百姓受更多苦难，决定辅佐燕王登基。他和纪纲在燕王身边完美配合，为日后燕王的登基做出了巨大贡献。
