一心想成为幽灵猎人的天空寺尊于18岁生日时，收到来自十年前亡父生前所寄的幽灵眼魂（Ghost Eyecon）后，来自异世界的怪人——眼魔突如其来地出现在面前并盯上此物，甚至为救青梅竹马月村明里和御成而身亡。得到仙人的帮助之下而获得Ghost驱动器变身，成为假面骑士Ghost并得以九十九日短暂的生命复苏。为收集实现复活愿望的「15位伟人」眼魂，投身于影响世界命运的战斗中。
七年前，凡人太子厉寒一家被七个仙人所杀，奄奄一息之际，他和妹妹厉瑶被传说中的无尽神域所救。七年后，厉寒归来，为了唤醒妹妹，他必须按神域要求不断提升修为守护苍生，与此同时他也誓要找到当年的凶手，报仇雪恨！但事情远比他想象的要复杂，随着真相一点点被揭露，厉寒必须要在报仇和报恩之间做出抉择……
